功能基因组、长非编码RNA、表观遗传学培训班

发布时间:2017-07-27 预览:316
  • 主题方向:功能基因组、长非编码RNA、表观遗传学培训班
  • 会议时间:2017年8月18日 - 8月21日
  • 举办天数:4天
  • 会议地点:山东省 - 济南 - 山东大学 计算中心
  • 主 办 方 :中国科学院计算技术研究所 烟台分所
  • 联 系 人 :张爱国
  • 联系电话:13683111214
  • E-mail:1256090094@qq.com
  • 管 理 员 zhangaiguo 
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    本期培训班有着丰富的内容,前沿科研技术,培训班中包括了非编码RNA 的功能研究策略与科研设计,研究关键技术等,涵盖长链非编码RNA、小分子RNA与表观遗传学的完整解决方案,理论讲解和实验操作结合,让你更快更好地掌握时下科研技术与科研方向。培训内容:一、DNA测序
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    本期培训班有着丰富的内容,前沿科研技术,培训班中包括了非编码RNA 的功能研究策略与科研设计,研究关键技术等,涵盖长链非编码RNA、小分子RNA与表观遗传学的完整解决方案,理论讲解和实验操作结合,让你更快更好地掌握时下科研技术与科研方向。

    培训内容:

    一、DNA测序技术-原理及技术

    a)第二代测序技术:Illumina,454, Ion Torrent原理

    b)第三代测序技术:PacBio, Hellicos原理

    c)第四代测序技术:Oxford NanoPore原理

    d)Hybridization based methods

    e)测序技术的比较及展望 

    二、基因组编辑技术(CRIPR技术)

    a)不同基因组编辑技术的比较Meganuclease,ZFN,TALEN,          

    b)CRISPR-Cas9

    c)CRISPR-Cas系统的作用机理

    d)CRISPR-Cas系统在基因组编辑中的应用

    e)CRISPR-Cas系统的其他应用

    三、生物信息学基本实验技能

    a)Linux常用命令 

    b)EMBOSS,经典序列分析工具集

    c)Perl编程基础

    四、小RNA(microRNA)研究方法及案例

    a)实验流程

    b)数据处理比对

    c)靶基因富集分析

    d )miRNA-mRNA关联分析

    e)主要工具包的使用:miRDeep,mirDeep*

    五、长非编码RNA(lncRNA)研究方法及案例

    a)实验流程

    b)lncRNA的发现和分类

    c) 功能分类

    d)主要工具包的使用:lncRScan,LncRNAFunction等  

    六、表观遗传学研究方法及案例

    a )DNA methylation, MeDIP-seq

    b )Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo

    c )Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq

    d )Chromatin accessibility, DNase-seq

    e )3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C 

    七、基于DNA/RNA测序技术的功能基因组学研究策略分析

    a )ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq

    b )RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq

    c )Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d 

    d )Smart-Seq2

    e )Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq 

    非编码RNA和表观遗传学是近年来生命科学领域的研究热点,非编码RNA在包括发育、免疫、生殖等基本生理过程中扮演了不可替代的角色,同时在包括多种重大疾病中也发挥重要作用。2016年,表观转录组分析(Epitranscriptome analysis)荣膺Nature Methods年度生命科学技术,目前已知的RNA修饰超过100种,其中很多修饰能参与到真核基因表达调控。非编码RNA和RNA表观遗传学的研究,将加深人类对生命系统复杂调控网的理解和认识,并为疾病的研究和治疗提供新的视角,有望从中发现新的分子标志物与治疗靶点。

    报名须知:

    1.注册费:4300元/人;(包括培训费、资料费、上机费、考试费等;食宿统一安排,费用自理) 

    2.团体优惠:同一单位5位学员参加,可额外赠送1个免费名额; 

    3.本次培训班共35个名额,培训座位按收到报名表先后顺序安排。

    主办单位:中国科学院计算技术研究所 烟台分所

    培训地点:山东大学 计算中心

    培训时间:2017.8.18——8.21

    联系人:张爱国

    联系电话:13683111214

    咨询电话:010-58032788

    邮箱:1256090094@qq.com


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本期培训班有着丰富的内容,前沿科研技术,培训班中包括了非编码RNA 的功能研究策略与科研设计,研究关键技术等,涵盖长链非编码RNA、小分子RNA与表观遗传学的完整解决方案,理论讲解和实验操作结合,让你更快更好地掌握时下科研技术与科研方向。

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